Zero-inflated generalized Dirichlet multinomial regression model for microbiome compositional data analysis

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Variable Selection for Sparse Dirichlet-multinomial Regression with an Application to Microbiome Data Analysis.

With the development of next generation sequencing technology, researchers have now been able to study the microbiome composition using direct sequencing, whose output are bacterial taxa counts for each microbiome sample. One goal of microbiome study is to associate the microbiome composition with environmental covariates. We propose to model the taxa counts using a Dirichlet-multinomial (DM) r...

متن کامل

a new approach to credibility premium for zero-inflated poisson models for panel data

هدف اصلی از این تحقیق به دست آوردن و مقایسه حق بیمه باورمندی در مدل های شمارشی گزارش نشده برای داده های طولی می باشد. در این تحقیق حق بیمه های پبش گویی بر اساس توابع ضرر مربع خطا و نمایی محاسبه شده و با هم مقایسه می شود. تمایل به گرفتن پاداش و جایزه یکی از دلایل مهم برای گزارش ندادن تصادفات می باشد و افراد برای استفاده از تخفیف اغلب از گزارش تصادفات با هزینه پائین خودداری می کنند، در این تحقیق ...

15 صفحه اول

Deep Dirichlet Multinomial Regression

Dirichlet Multinomial Regression (DMR) and other supervised topic models can incorporate arbitrary document-level features to inform topic priors. However, their ability to model corpora are limited by the representation and selection of these features – a choice the topic modeler must make. Instead, we seek models that can learn the feature representations upon which to condition topic selecti...

متن کامل

Zero-Inflated Generalized Poisson Regression Model with an Application to Domestic Violence Data

The generalized Poisson regression model has been used to model dispersed count data. It is a good competitor to the negative binomial regression model when the count data is over-dispersed. Zero-inflated Poisson and zero-inflated negative binomial regression models have been proposed for the situations where the data generating process results into too many zeros. In this paper, we propose a z...

متن کامل

Constrained Generalized Additive Model with Zero-Inflated Data

Zero inflation problem is very common in ecological studies as well as other areas. We propose the COnstrained Zero-Inflated Generalized Additive Model (COZIGAM) for analyzing zero-inflated data. Our approach assumes that the response follows some distribution from the zero-inflated 1-parameter exponential family, with the further assumption that the probability of zero inflation is some monoto...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Biostatistics

سال: 2018

ISSN: 1465-4644,1468-4357

DOI: 10.1093/biostatistics/kxy025